吕布大喝道：“誓当杀此老贼，以雪吾耻！”

王允急掩其口：“将军勿言，恐累及老夫。”

吕布大声说道：“大丈夫生居天地间，岂能郁郁久居人下！”

王允循循善诱：“以将军之才，诚非董太师所可限制。”

吕布怒道：“吾欲杀此老贼，乃是父子之情，恐惹后人议论。”

王允微笑道：“将军自姓吕，太师自姓董。掷戟之时，岂有父子情耶？”

吕布奋然：“非司徒言，布几自误！”

吕布被王允说服，于是决定助他诛杀董卓。

四月二十三日辛巳，天子大病初愈。朝廷百官在未央宫集合，恭祝天子龙体安康。王允决定趁此机会行动，令士孙瑞书写诏书交给吕布，吕布怀着诏书，派同郡骑都尉李肃等人带领十多名心腹亲兵，穿上宫廷侍卫的服装，潜伏在宫殿侧门两边。

董卓乘车前往未央宫，参与庆祝皇帝病愈的朝贺，吕布随从护卫。

出门前马受惊，使董卓坠入泥中，董卓回府更衣，其少妻劝其不要进宫，董卓不听。当董卓车队行至北掖门外时，李肃等人持长戟冲出，刺向董卓，董卓朝服内穿铠甲，所以未伤及要害，而李肃刺伤董卓手臂，并将其刺下车来，董卓疾呼：“吕布何在？！”

这时候吕布不慌不忙的掏出准备好的诏书，喊道：“有诏讨贼臣！”

直到此时，董卓才发现吕布背叛了自己，大骂吕布：“庸狗敢如是邪！”

吕布则率众人上前将董卓当场斩杀。太师府主簿田景及仆人上前抱住董卓的尸体，吕布又将他们杀死，杀了这三人之后，在场其他的人都不敢动了。

随后，王允立刻让信使往各政府部门送达赦免诏书。董卓的死讯传出，士兵们都高呼万岁，百姓在路上载歌载舞，很多人把珠宝去换成酒肉来庆祝。接着，皇甫嵩攻打郿坞，将董卓全族男女杀得一干二净。当时天气很热，董卓肥胖的尸体流出脂肪，守尸吏在董卓肚脐中点火，竟然“光明达曙，如是积日”。袁氏家族的门生又将董卓挫骨扬灰。郿坞中珍藏有金二三万斤，银八九万斤，锦绮缋縠纨素奇玩，积如丘山。

自此，王允录尚书事，总朝政，遣使张种抚慰山东。

他因为诛杀董卓有功，飘飘然起来，居功自傲，不把任何人放在眼里。